Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG7O95352 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG7O95352 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG7O95352 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG7O95352 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG7O95352 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG7O95352 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG7O95352 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG7O95352 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG7O95352 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG7O95352 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG7O95352 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms