Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPBO95292 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPBO95292 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPBO95292 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VAPBO95292 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.33■■□□□ 1
VAPBO95292 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VAPBO95292 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPBO95292 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPBO95292 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms