Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD4O95243 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD4O95243 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD4O95243 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD4O95243 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD4O95243 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD4O95243 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD4O95243 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD4O95243 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms