Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN3O95197 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN3O95197 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN3O95197 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN3O95197 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN3O95197 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN3O95197 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN3O95197 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN3O95197 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN3O95197 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms