Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UFL1O94874 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UFL1O94874 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UFL1O94874 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UFL1O94874 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UFL1O94874 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UFL1O94874 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UFL1O94874 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms