Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms