Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL5O76039 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL5O76039 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms