Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BBOX1O75936 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBOX1O75936 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BBOX1O75936 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms