Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX3O75364 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PITX3O75364 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PITX3O75364 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms