Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNOT3O75175 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNOT3O75175 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms