Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLO75128 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLO75128 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLO75128 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLO75128 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLO75128 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLO75128 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLO75128 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLO75128 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLO75128 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLO75128 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLO75128 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLO75128 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLO75128 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLO75128 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLO75128 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLO75128 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms