Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR5O60602 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR5O60602 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR5O60602 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR5O60602 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR5O60602 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR5O60602 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR5O60602 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR5O60602 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR5O60602 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms