Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMFO60524 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMFO60524 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMFO60524 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMFO60524 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMFO60524 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMFO60524 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMFO60524 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMFO60524 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMFO60524 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMFO60524 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMFO60524 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMFO60524 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMFO60524 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMFO60524 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMFO60524 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMFO60524 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMFO60524 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMFO60524 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMFO60524 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms