Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPLO60437 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PPLO60437 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PPLO60437 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPLO60437 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPLO60437 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPLO60437 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPLO60437 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPLO60437 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPLO60437 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPLO60437 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPLO60437 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPLO60437 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPLO60437 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPLO60437 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPLO60437 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPLO60437 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms