Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP8B3O60423 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms