Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH6O60337 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms