Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP104O60308 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP104O60308 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP104O60308 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP104O60308 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP104O60308 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP104O60308 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP104O60308 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms