Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA2O43921 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms