Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB2O43741 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB2O43741 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms