Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCK2O43639 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCK2O43639 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCK2O43639 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCK2O43639 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCK2O43639 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCK2O43639 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCK2O43639 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCK2O43639 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms