Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HTRA2O43464 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA2O43464 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms