Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFA2T2O43439 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms