Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD3O43242 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD3O43242 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms