Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VGFO15240 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VGFO15240 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VGFO15240 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VGFO15240 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VGFO15240 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VGFO15240 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VGFO15240 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
VGFO15240 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
VGFO15240 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VGFO15240 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VGFO15240 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VGFO15240 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VGFO15240 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VGFO15240 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VGFO15240 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VGFO15240 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VGFO15240 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VGFO15240 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VGFO15240 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
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