Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APAF1O14727 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APAF1O14727 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APAF1O14727 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APAF1O14727 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APAF1O14727 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APAF1O14727 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APAF1O14727 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APAF1O14727 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
APAF1O14727 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APAF1O14727 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APAF1O14727 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APAF1O14727 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APAF1O14727 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APAF1O14727 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APAF1O14727 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APAF1O14727 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms