Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBAG9O00559 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBAG9O00559 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EBAG9O00559 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBAG9O00559 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBAG9O00559 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms