Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOC4-APOC2K7ER74 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms