Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-1B6SEH8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms