Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD1B0YJ81 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD1B0YJ81 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms