Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ3A6PVS8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRIQ3A6PVS8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ3A6PVS8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms