Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC53A6NM62 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC53A6NM62 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms