Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01546A6NGU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01546A6NGU7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms