Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf92A6NGG3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms