Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms