Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLRN2A0PK11 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms