Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-201ENST00000260058 1431 ntTSL 218.16■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-202ENST00000490820 4329 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-208ENST00000531515 724 ntTSL 315.08■□□□□ 03e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-8■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.95e-8■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-216ENST00000584206 715 ntTSL 46.97□□□□□ -1.295e-9■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 DUS1L-213ENST00000580731 725 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-216ENST00000576335 645 ntTSL 511.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-205ENST00000524733 835 ntTSL 318.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-207ENST00000527430 692 ntTSL 317.84■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-204ENST00000479032 1004 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-209ENST00000531401 858 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-210ENST00000533015 563 ntTSL 212.53□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-209ENST00000469588 950 ntTSL 222.07■■□□□ 1.121e-23■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-203ENST00000445139 856 ntTSL 514.07□□□□□ -0.161e-23■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 513.93□□□□□ -0.181e-23■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-218ENST00000496775 729 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-23■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-204ENST00000460258 837 ntTSL 413.23□□□□□ -0.291e-23■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PPP4R3B-204ENST00000612688 2981 ntTSL 212.8□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)21.07■□□□□ 0.969e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.679e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 514.61□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 512.98□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 512.62□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 COG5-209ENST00000484237 574 ntTSL 47.12□□□□□ -1.276e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 MYSM1-207ENST00000493821 7793 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 215.19■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 314.58□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 HSPG2-212ENST00000493940 584 ntTSL 513.5□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 UBE2Z-204ENST00000506498 766 ntTSL 411.87□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 ATF2-207ENST00000409833 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 ATF2-216ENST00000435231 784 ntTSL 511.21□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 ATF2-208ENST00000413123 681 ntTSL 510.73□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 ATF2-218ENST00000445349 483 ntTSL 49.47□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 ATF2-217ENST00000437522 883 ntTSL 57.32□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 TBCE-206ENST00000482230 1050 ntTSL 515.89■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 TBCE-205ENST00000472011 1840 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 TBCE-203ENST00000461651 567 ntTSL 410.41□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.147e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-204ENST00000438028 1822 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.957e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)20.14■□□□□ 0.817e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-202ENST00000422808 1599 ntTSL 1 (best)19.87■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)19.21■□□□□ 0.677e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-210ENST00000457519 2074 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.647e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.597e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 PILRB-211ENST00000493091 4345 ntTSL 214.6□□□□□ -0.077e-8■■■■■ 45.7
UTP3Q9NQZ2 ILF3-215ENST00000589485 620 ntTSL 222.09■■□□□ 1.135e-23■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 ILF3-214ENST00000589416 773 ntTSL 416.62■□□□□ 0.255e-23■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 ILF3-207ENST00000587840 655 ntTSL 516.32■□□□□ 0.25e-23■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 ILF3-212ENST00000589173 570 ntTSL 515.17■□□□□ 0.025e-23■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 ARF1-208ENST00000478336 930 ntTSL 225.6■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 ARF1-212ENST00000497165 675 ntTSL 316.72■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 ARF1-202ENST00000469235 678 ntTSL 316.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 TAL1-204ENST00000464796 237 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 TPM4-215ENST00000592138 635 ntTSL 210.34□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 45.6
UTP3Q9NQZ2 HYOU1-206ENST00000530467 552 ntTSL 420.66■□□□□ 0.95e-13■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2AC-201ENST00000314088 1668 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.555e-13■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.435e-13■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.255e-13■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 DKC1-206ENST00000452771 708 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 KDM3A-212ENST00000485171 556 ntTSL 46.15□□□□□ -1.425e-13■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 NOP56-213ENST00000480992 929 ntTSL 513.3□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-209ENST00000437652 911 ntTSL 327.68■■■□□ 2.029e-7■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-205ENST00000412596 980 ntTSL 527.17■■□□□ 1.949e-7■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-211ENST00000456325 812 ntTSL 318.59■□□□□ 0.579e-7■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-210ENST00000441890 678 ntTSL 218.23■□□□□ 0.519e-7■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-204ENST00000368504 1120 ntTSL 514.55□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-223ENST00000451310 801 ntTSL 218.7■□□□□ 0.584e-16■■■■■ 45.5
UTP3Q9NQZ2 CAST-205ENST00000348386 2272 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 45.4
UTP3Q9NQZ2 USP15-206ENST00000546718 559 ntTSL 215.24■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 45.4
UTP3Q9NQZ2 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 45.4
UTP3Q9NQZ2 GRK6-204ENST00000502598 557 ntTSL 419.88■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 45.4
UTP3Q9NQZ2 GRK6-208ENST00000511244 555 ntTSL 418.5■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 45.4
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-208ENST00000511743 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.14□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-211ENST00000460862 551 ntTSL 421.32■■□□□ 12e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-204ENST00000427072 557 ntTSL 421.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-214ENST00000466598 684 ntTSL 221.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 45.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3689.3 ms