Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYQ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYQ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYQ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYQ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYQ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYQ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYQ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYQ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYQ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms