Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN6Q9Y6Q1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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