Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD54BQ9Y620 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms