Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX8Q9Y5X2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX8Q9Y5X2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms