Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms