Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms