Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB4Q9Y5E5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms