Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXND1Q9Y4D7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXND1Q9Y4D7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms