Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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HCN4Q9Y3Q4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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HCN4Q9Y3Q4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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HCN4Q9Y3Q4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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HCN4Q9Y3Q4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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