Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms