Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms