Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC4Q9Y296 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms