Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNQ9UQP3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms