Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS3Q9UPU3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms